М.Ходорковский переводил деньги на счета В.Гусинского
По мнению суда, своими действиями М.Ходорковский причинил ущерб собственникам этих средств. Таким образом, М.Ходорковским и П.Лебедевым была совершена растрата (хищение) чужого имущества (статья 160 УК РФ).
Суд также установил, что М.Ходорковский и П.Лебедев совершили мошенническое завладение бюджетными средствами, получив переплату налогов в ЗАТО "Лесной" на сумму 407 млн руб.
Кроме того, в период с 1999 по 2000гг. М.Ходорковский и П.Лебедев, являющиеся основными акционерами НК "ЮКОС", в составе организованной группы обеспечили уклонение от уплаты налогов коммерческими организациями, занимающимися сбытом нефти и нефтепродуктов. Для этого использовались 4 подставные фирмы: ООО "Бизнес-Ойл", "Митра", "Вальд-Ойл" и "Форест-Ойл", зарегистрированные в зоне льготного налогообложения - ЗАТО "Лесной" (Нижнетуринского района, Свердловской области).
Также суд заявил, что вина М.Ходорковского и П.Лебедева по мошенническому завладению 44% акций НИИУИФа подтверждается доказательствами в деле.
М.Ходорковский и П.Лебедев организовали уклонение от уплаты налогов с организации в особо крупном размере иным способом - оплатой налоговых платежей не денежными средствами, а векселями НК "ЮКОС". От имени вышеуказанных коммерческих организаций было обеспечено уклонение от уплаты налогов на общую сумму 17 млрд 395 млн руб.