В границы Большого порта Петербург включены сооружения "Терминал-Сервиса" и "Василеостровского грузового терминала".
Комитет по транспортно-транзитной политике Санкт-Петербурга (КТТП) подписал трехсторонние соглашения с собственниками и операторами морских грузовых терминалов, действующих на территории Васильевского острова Санкт-Петербурга, но до настоящего момента не входящих в состав Большого морского порта Санкт-Петербург. По сообщению пресс-службы порта, портовые гидротехнические сооружения перевалочных комплексов ООО "Терминал-Сервис", действующего на территории ОАО "Балтийский завод" и ЗАО "Василеостровский грузовой терминал", расположенное на северном берегу Васильевского острова, будут временно включены в границы Большого порта Санкт-Петербург. Стороны договорились, что переходный период составит 3 года.
Большой морской порт расположен на островах дельты р.Невы в восточной части Финского залива Балтийского моря. Акватория порта состоит из пяти бассейнов: Восточный, Барочный, Пассажирский, рейд Лесного мола и Угольная Гавань. Территория порта составляет 269 га.
Вопрос о границах Большого морского порта Санкт-Петербург поднимался не раз. По словам министра транспорта, окончательно границы Большого морского порта Санкт-Петербурга будут окончательно утверждены к октябрю 2008г.